wrf era

Any issues with the actual running of the WRF.

wrf era

Postby nunciom » Thu Apr 26, 2018 4:52 am

Dear all,
I am a new user of WRF. While running the model with ERA interim the following error is encountered.
How to get around this
thank you
nuncio

Ntasks in X 1, ntasks in Y 1
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain 1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain 1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain 1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
--- NOTE: num_soil_layers has been set to 4
WRF V3.6.1 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde 1 74 1 61
ims,ime,jms,jme -4 79 -4 66
ips,ipe,jps,jpe 1 74 1 61
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
alloc_space_field: domain 1, 133721260 bytes allocated
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE: <stdin> LINE: 70
program wrf: error opening wrfinput_d01 for reading ierr= -1021
-------------------------------------------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
nunciom
 
Posts: 1
Joined: Thu Apr 26, 2018 4:46 am

Re: wrf era

Postby ggray » Thu Sep 26, 2019 10:26 am

Hello all-

My name is Geneva and I was wondering if anyone solved this problem since I am encountering something similar. I'm initializing with ERA5 and using 4 nested domains to get to 1km. real.exe completes but I'm having issues with wrf.exe. Specifically the program stops because it cannot open wrfinput_d04 reading ierr = -1021.

1) wrfinput_d04 does exist, real.exe doesn't flag any errors when creating it, and the ncview values look reasonable.
2) I've checked to make sure everything (WPS, WRF, and dependent libraries) are compiled using the same intel processor.

Here is the rsl.error.0000 file:
Code: Select all
taskid: 0 hostname: r2n06
 module_io_quilt_old.F        2931 F
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
 Ntasks in X            8 , ntasks in Y           16
WRF V4.0 MODEL
 *************************************
 Parent domain
 ids,ide,jds,jde            1         281           1         165
 ims,ime,jms,jme           -4          42          -4          18
 ips,ipe,jps,jpe            1          35           1          11
 *************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1 ,               33491004  bytes allocated
  med_initialdata_input: calling input_input
   Input data is acceptable to use: wrfinput_d01
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    1.10240 elapsed seconds
Max map factor in domain 1 =  1.08. Scale the dt in the model accordingly.
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
ThompMP: read qr_acr_qg.dat instead of computing
ThompMP: read qr_acr_qs.dat instead of computing
ThompMP: read freezeH2O.dat instead of computing
 *************************************
 Nesting domain
 ids,ide,jds,jde            1         403           1         394
 ims,ime,jms,jme           -4          63          -4          36
 ips,ipe,jps,jpe            1          51           1          25
 INTERMEDIATE domain
 ids,ide,jds,jde          135         274          18         154
 ims,ime,jms,jme          130         163          13          37
 ips,ipe,jps,jpe          133         153          16          27
 *************************************
d01 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            2 ,                9373800  bytes allocated
d01 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            2 ,               81523548  bytes allocated
d01 2015-10-29_00:00:00 *** Initializing nest domain # 2 from an input file. ***
d01 2015-10-29_00:00:00 med_initialdata_input: calling input_input
d01 2015-10-29_00:00:00  Input data is acceptable to use: wrfinput_d02
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        2:    2.90699 elapsed seconds
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
Max map factor in domain 1 =  1.08. Scale the dt in the model accordingly.
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
 mediation_integrate.G        1943 DATASET=HISTORY
 mediation_integrate.G        1944  grid%id            1  grid%oid            1
Timing for Writing wrfout_d01_2015-10-29_00:00:00 for domain        1:    2.41646 elapsed seconds
Timing for Writing wrfxtrm_d01_2015-10-29_00:00:00 for domain        1:    0.06981 elapsed seconds
d01 2015-10-29_00:00:00  Input data is acceptable to use: wrfbdy_d01
Timing for processing lateral boundary for domain        1:    0.30955 elapsed seconds
 Tile Strategy is not specified. Assuming 1D-Y
WRF TILE   1 IS      1 IE     35 JS      1 JE     11
WRF NUMBER OF TILES =   1
d01 2015-10-29_00:00:00 Re-initializing accumulation arrays
 *************************************
 Nesting domain
 ids,ide,jds,jde            1         529           1         556
 ims,ime,jms,jme           -4          78          -4          45
 ips,ipe,jps,jpe            1          66           1          35
 INTERMEDIATE domain
 ids,ide,jds,jde           55         236         159         349
 ims,ime,jms,jme           50          88         154         182
 ips,ipe,jps,jpe           53          78         157         172
 *************************************
d02 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            3 ,               12472668  bytes allocated
d02 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            3 ,              118807004  bytes allocated
d02 2015-10-29_00:00:00 *** Initializing nest domain # 3 from an input file. ***
d02 2015-10-29_00:00:00 med_initialdata_input: calling input_input
d02 2015-10-29_00:00:00  Input data is acceptable to use: wrfinput_d03
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        3:    5.20031 elapsed seconds
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
 LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           17  SNOW CATEGORY =           15
Climatological albedo is used instead of table values
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
 LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
 mediation_integrate.G        1943 DATASET=HISTORY
 mediation_integrate.G        1944  grid%id            2  grid%oid            3
Timing for Writing wrfout_d02_2015-10-29_00:00:00 for domain        2:    8.39562 elapsed seconds
Timing for Writing wrfxtrm_d02_2015-10-29_00:00:00 for domain        2:    0.14962 elapsed seconds
 Tile Strategy is not specified. Assuming 1D-Y
WRF TILE   1 IS      1 IE     51 JS      1 JE     25
WRF NUMBER OF TILES =   1
d02 2015-10-29_00:00:00 Re-initializing accumulation arrays
 *************************************
 Nesting domain
 ids,ide,jds,jde            1         673           1         889
 ims,ime,jms,jme           -4          96          -4          66
 ips,ipe,jps,jpe            1          84           1          56
 INTERMEDIATE domain
 ids,ide,jds,jde          204         433         109         410
 ims,ime,jms,jme          199         243         104         139
 ips,ipe,jps,jpe          202         233         107         129
 *************************************
d03 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            4 ,               17865360  bytes allocated
d03 2015-10-29_00:00:00  alloc_space_field: domain            4 ,              201675608  bytes allocated
d03 2015-10-29_00:00:00 *** Initializing nest domain # 4 from an input file. ***
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  <stdin>  LINE:      70
 program wrf: error opening wrfinput_d04 for reading ierr=       -1021
-------------------------------------------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0


Here is my namelist:
Code: Select all
&time_control
 start_year                          = 2015, 2015, 2015, 2015,
 start_month                         = 10, 10, 10, 10,
 start_day                           = 29, 29, 29, 29,
 start_hour                          = 00, 00, 00, 00,
 start_minute                        = 00, 00, 00, 00,
 start_second                        = 00, 00, 00, 00,
 end_year                            = 2015, 2015, 2015, 2015,
 end_month                           = 11, 11, 11, 11,
 end_day                             = 01, 01, 01, 01,
 end_hour                            = 21, 21, 21, 21,
 end_minute                          = 00, 00, 00, 00,
 end_second                          = 00, 00, 00, 00,
 interval_seconds                    = 10800,
 input_from_file                     = .true., .true., .true., .true.,
 fine_input_stream                   = 0, 0, 0, 0,
 history_interval                    = 120, 120, 60, 60,
 frames_per_outfile                  = 1, 1, 1, 1,
 restart                             = .FALSE.,
 cycling                             = .false.,
 restart_interval                    = 180,
 reset_simulation_start              = .false.,
 io_form_history                     = 2,
 io_form_restart                     = 2,
 io_form_input                       = 2,
 io_form_boundary                    = 2,
 debug_level                         = 0,
 diag_print                          = 2,
 nocolons                            = .false.,
 output_diagnostics                  = 1,
 auxhist3_outname                    = wrfxtrm_d<domain>_<date>,
 auxhist3_interval                   = 120, 120, 120, 120,
 frames_per_auxhist3                 = 100, 100, 100, 100,
 io_form_auxhist3                    = 2,
 write_hist_at_0h_rst                = .true.,
 /

 &domains
 time_step                           = 81,
 time_step_fract_num                 = 0,
 time_step_fract_den                 = 1,
 max_dom                             = 4,
 s_we                                = 1, 1, 1, 1,
 e_we                                = 281, 403, 529, 673,
 s_sn                                = 1, 1, 1, 1,
 e_sn                                = 165, 394, 556, 889
 s_vert                              = 1, 1, 1, 1,
 e_vert                              = 40, 40, 40, 40
 p_top_requested                     = 5000,
 num_metgrid_levels                  = 138,
 num_metgrid_soil_levels             = 3,
 dx                                  = 27000, 9000, 3000, 1000,
 dy                                  = 27000, 9000, 3000, 1000,
 force_sfc_in_vinterp                = 1,
 interp_type                         = 2,
 extrap_type                         = 2,
 t_extrap_type                       = 2,
 use_levels_below_ground             = .true.,
 use_surface                         = .true.,
 lagrange_order                      = 2,
 zap_close_levels                    = 500.,
 lowest_lev_from_sfc                 = .false.,
 sfcp_to_sfcp                        = .true.,
 smooth_cg_topo                      = .false.,
 use_tavg_for_tsk                    = .false.,
 rh2qv_wrt_liquid                    = .true.,
 grid_id                             = 1, 2, 3, 4,
 parent_id                           = 1, 1, 2, 3,
 i_parent_start                      = 1, 137, 57, 206,
 j_parent_start                      = 1, 20, 161, 111,
 parent_grid_ratio                   = 1, 3, 3, 3,
 parent_time_step_ratio              = 1, 3, 3, 3,
 feedback                            = 1,
 smooth_option                       = 0,
 use_adaptive_time_step              = .true.,
 step_to_output_time                 = .true.,
 target_cfl                          = 1.2, 1.2, 1.2, 1.2,
 max_step_increase_pct               = 5, 51, 51, 51,
 starting_time_step                  = -1, -1, -1, -1,
 max_time_step                       = -1, -1, -1, -1,
 min_time_step                       = -1, -1, -1, -1,
 adaptation_domain                   = 1,
 tile_sz_x                           = 0,
 tile_sz_y                           = 0,
 numtiles                            = 1,
 nproc_x                             = -1,
 nproc_y                             = -1,
 /

 &physics
 mp_physics                          = 8, 8, 8, 8,
 mp_zero_out                         = 2,
 mp_zero_out_thresh                  = 1.0e-14,
 ra_lw_physics                       = 4, 4, 4, 4,
 ra_sw_physics                       = 4, 4, 4, 4,
 radt                                = 15, 15, 15, 15,
 co2tf                               = 1,
 sf_sfclay_physics                   = 2, 2, 2, 2,
 num_soil_layers                     = 4,
 pxlsm_smois_init                    = 1,
 sf_surface_physics                  = 2, 2, 2, 2,
 sf_surface_mosaic                   = 0,
 mosaic_cat                          = 3,
 sf_urban_physics                    = 0, 0, 0, 0,
 bl_pbl_physics                      = 2, 2, 2, 2,
 bldt                                = 0, 0, 0, 0,
 cu_physics                          = 1, 1, 0, 0,
 cudt                                = 0,
 isfflx                              = 1,
 ifsnow                              = 1,
 icloud                              = 1,
 cu_rad_feedback                     = .true.,.true.,.true.,.true.,
 surface_input_source                = 1,
 num_land_cat                        = 21,
 num_soil_cat                        = 16,
 sst_update                          = 0,
 maxiens                             = 1,
 maxens                              = 3,
 maxens2                             = 3,
 maxens3                             = 16,
 ensdim                              = 144,
 seaice_threshold                    = 271,
 usemonalb                           = .true.,
 rdmaxalb                            = .true.,
 rdlai2d                             = .false.,
 sst_skin                            = 1,
 tmn_update                          = 1,
 lagday                              = 90,
 fractional_seaice                   = 0,
 iz0tlnd                             = 1,
 bucket_mm                           =1000.0,
 bucket_J                            =1.e9,
 /

 &dynamics
 rk_ord                              = 3,
 w_damping                           = 1,
 diff_opt                            = 2,
 km_opt                              = 4,
 diff_6th_opt                        = 2, 2, 2, 2,
 diff_6th_factor                     = 0.12, 0.12, 0.12, 0.12,
 damp_opt                            = 3,
 use_theta_m                         = 0,
 base_temp                           = 290.
 zdamp                               = 5000., 5000., 5000., 5000.,
 dampcoef                            = 0.05, 0.05, 0.05, 0.05,
 khdif                               = 0, 0, 0, 0,
 kvdif                               = 0, 0, 0, 0,
 smdiv                               = 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
 emdiv                               = 0.01, 0.01, 0.01, 0.01,
 epssm                               = 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
 non_hydrostatic                     = .true., .true., .true., .true.,
 top_lid                             = .false., .false., .false., .false.,
 mix_full_fields                     = .true., .true., .true., .true.,
 mix_isotropic                       = 0, 0, 0, 0,
 mix_upper_bound                     = 0.1, 0.1, 0.1, 0.1,
 tke_drag_coefficient                = 0.0, 0.0, 0.0, 0.0,
 tke_heat_flux                       = 0.0, 0.0, 0.0, 0.0,
 h_mom_adv_order                     = 5, 5, 5, 5,
 v_mom_adv_order                     = 3, 3, 3, 3,
 h_sca_adv_order                     = 5, 5, 5, 5,
 v_sca_adv_order                     = 3, 3, 3, 3,
 moist_adv_opt                       = 2, 2, 2, 2,
 scalar_adv_opt                      = 2, 2, 2, 2,
 chem_adv_opt                        = 1, 1, 1, 1,
 tke_adv_opt                         = 2, 2, 2, 2,
 time_step_sound                     = 4, 4, 4, 4,
 fft_filter_lat                      = 45,
 gwd_opt                             = 0,
 hybrid_opt                          = 2,
 etac                                = 0.2,
 /

 &bdy_control
 spec_bdy_width                      = 5,
 spec_zone                           = 1,
 relax_zone                          = 4,
 specified                           = .true.,
 spec_exp                            = 0.33,
 nested                              = .false., .true., .true., .true.,
 /

 &grib2
 /

 &namelist_quilt
 nio_tasks_per_group = 0,
 nio_groups = 1,
 /



Thank you in advance for any insight you may be able to provide. I've only been using WRF for the last year so I'm still learning.

Best,
Geneva
ggray
 
Posts: 1
Joined: Thu Aug 30, 2018 12:47 pm


Return to Runtime Problems

Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 8 guests