Convert_emiss error

Any issues with running WRF Chemistry

Convert_emiss error

Postby Jake » Tue Jun 23, 2015 5:22 am

Hey guys! :D

I've been trying to run the convert_emiss for anthropogenic emissions and gocart background emission and i always encounter an error regarding the NETCDF. I have already set the path to it, and i am clueless on what to do to fix this issue.
This one shows that there are errors just like this (Full code is below)

" NetCDF error: NetCDF: Variable not found
NetCDF error in wrf_io.F90, line 2861 Varname ora1
input_wrf.F reading 4d real ora1 Status = -1021
input_wrf.F reading 4d real ora2
date 2015-01-01_00:00:00"

then after a while this would show up:"READ GOCART BACKGROUND DATA
At line 389 of file convert_emiss.f90 (unit = 19, file = 'wrf_gocart_backg')
Fortran runtime error: End of file"

Code: Select all
taskid: 0 hostname: Earth-Z820
 Ntasks in X            1 , ntasks in Y            1
WRF-CHEM V3.6.1 EMISSIONS PREPROCESSOR
 *************************************
 Parent domain
 ids,ide,jds,jde            1         116           1         116
 ims,ime,jms,jme           -4         121          -4         121
 ips,ipe,jps,jpe            1         116           1         116
 *************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1 ,            2071992320  bytes allocated
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-05_00:00:00]
   DEBUG wrf_timeinttoa():  returning with str = [0000000000_000:000:030]
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock start time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock current time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock stop time = 2015-01-05_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock time step = 0000000000_000:000:030
   setup_timekeeping:  set xtime to    0.0000000
   setup_timekeeping:  set julian to    0.0000000
  setup_timekeeping:  returning...
  convert_gocart: calling model_to_grid_config_rec
  convert_gocart: calling set_scalar_indices_from_config
  convert_gocart: calling init_wrfio
  module_io.F: in wrf_ioinit
  Entering ext_gr1_ioinit
   allocate for wrfinput_d01
   set scalars for wrfinput_d01
   construct filename for wrfinput_d01
 open file wrfinput_d01
  module_io.F: in wrf_open_for_read
  wrf main: calling open_r_dataset for wrfinput
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
  module_io.F: in wrf_open_for_read
  med_initialdata_input: calling input_input
   input_wrf: begin, fid =            2
  module_io.F: in wrf_inquire_filename
   input_wrf: fid,filestate =            2         103
   input_wrf: dryrun =  F  switch           26
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_char_arr
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for CEN_LAT returns    14.580002
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for CEN_LON returns    121.00000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for TRUELAT1 returns    14.580000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for TRUELAT2 returns    0.0000000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for MOAD_CEN_LAT returns    14.580002
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for STAND_LON returns    121.00000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for POLE_LAT returns    90.000000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for POLE_LON returns    0.0000000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_real_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_real for GMT returns    0.0000000
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for JULYR returns         2015
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for JULDAY returns            1
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for MAP_PROJ returns            3
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_char_arr
  mminlu = 'USGS'
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_char for MMINLU returns USGS
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: global attribute SF_SURFACE_PHYSICS returns            2
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for ISWATER returns           16
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for ISLAKE returns           -1
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for ISICE returns           24
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for ISURBAN returns            1
  module_io.F (md_calls.m4) : in wrf_get_dom_ti_integer_sca
   input_wrf: wrf_get_dom_ti_integer for ISOILWATER returns           14
  module_io.F: in wrf_get_next_time
             2  input_wrf: wrf_get_next_time current_date: 2015-01-01_00:00:00 Status =            0
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-05_00:00:00]
   DEBUG wrf_timeinttoa():  returning with str = [0000000000_006:000:000]
 DEBUG input_wrf():  get CurrTime from clock,  clock start time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG input_wrf():  get CurrTime from clock,  clock current time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG input_wrf():  get CurrTime from clock,  clock stop time = 2015-01-05_00:00:00
 DEBUG input_wrf():  get CurrTime from clock,  clock time step = 0000000000_006:000:000

  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real clayfrac Status =            0
input_wrf.F reading 2d real sandfrac
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real sandfrac Status =            0
input_wrf.F reading 2d real clayfrac_nga
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real clayfrac_nga Status =            0
input_wrf.F reading 2d real sandfrac_nga
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real sandfrac_nga Status =            0
input_wrf.F reading 2d real dms_0
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real dms_0 Status =            0
input_wrf.F reading 4d real so2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname so2
 input_wrf.F reading 4d real so2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real sulf
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname sulf
 input_wrf.F reading 4d real sulf Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real no2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname no2
 input_wrf.F reading 4d real no2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real no
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname no
 input_wrf.F reading 4d real no Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real o3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname o3
 input_wrf.F reading 4d real o3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hno3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hno3
 input_wrf.F reading 4d real hno3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real h2o2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname h2o2
 input_wrf.F reading 4d real h2o2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ald
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ald
 input_wrf.F reading 4d real ald Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hcho
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hcho
 input_wrf.F reading 4d real hcho Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real op1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname op1
 input_wrf.F reading 4d real op1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real op2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname op2
 input_wrf.F reading 4d real op2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real paa
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname paa
 input_wrf.F reading 4d real paa Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ora1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ora1
 input_wrf.F reading 4d real ora1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ora2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ora2
 input_wrf.F reading 4d real ora2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real nh3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname nh3
 input_wrf.F reading 4d real nh3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real n2o5
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname n2o5
 input_wrf.F reading 4d real n2o5 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real no3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname no3
 input_wrf.F reading 4d real no3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real pan
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname pan
 input_wrf.F reading 4d real pan Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hc3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hc3
 input_wrf.F reading 4d real hc3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hc5
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hc5
 input_wrf.F reading 4d real hc5 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hc8
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hc8
 input_wrf.F reading 4d real hc8 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real eth
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname eth
 input_wrf.F reading 4d real eth Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real co
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname co
 input_wrf.F reading 4d real co Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ol2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ol2
 input_wrf.F reading 4d real ol2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real olt
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname olt
 input_wrf.F reading 4d real olt Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real oli
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname oli
 input_wrf.F reading 4d real oli Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real tol
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname tol
 input_wrf.F reading 4d real tol Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real xyl
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname xyl
 input_wrf.F reading 4d real xyl Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real aco3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname aco3
 input_wrf.F reading 4d real aco3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real tpan
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname tpan
 input_wrf.F reading 4d real tpan Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hono
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hono
 input_wrf.F reading 4d real hono Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real hno4
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname hno4
 input_wrf.F reading 4d real hno4 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ket
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ket
 input_wrf.F reading 4d real ket Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real gly
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname gly
 input_wrf.F reading 4d real gly Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real mgly
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname mgly
 input_wrf.F reading 4d real mgly Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real dcb
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname dcb
 input_wrf.F reading 4d real dcb Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real onit
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname onit
 input_wrf.F reading 4d real onit Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real csl
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname csl
 input_wrf.F reading 4d real csl Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real iso
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname iso
 input_wrf.F reading 4d real iso Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real co2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname co2
 input_wrf.F reading 4d real co2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ch4
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ch4
 input_wrf.F reading 4d real ch4 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ho
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ho
 input_wrf.F reading 4d real ho Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real ho2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname ho2
 input_wrf.F reading 4d real ho2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real dms
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname dms
 input_wrf.F reading 4d real dms Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real msa
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname msa
 input_wrf.F reading 4d real msa Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real P25
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname P25
 input_wrf.F reading 4d real P25 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real BC1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname BC1
 input_wrf.F reading 4d real BC1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real BC2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname BC2
 input_wrf.F reading 4d real BC2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real OC1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname OC1
 input_wrf.F reading 4d real OC1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real OC2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname OC2
 input_wrf.F reading 4d real OC2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real DUST_1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname DUST_1
 input_wrf.F reading 4d real DUST_1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real DUST_2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname DUST_2
 input_wrf.F reading 4d real DUST_2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real DUST_3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname DUST_3
 input_wrf.F reading 4d real DUST_3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real DUST_4
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname DUST_4
 input_wrf.F reading 4d real DUST_4 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real DUST_5
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname DUST_5
 input_wrf.F reading 4d real DUST_5 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real SEAS_1
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname SEAS_1
 input_wrf.F reading 4d real SEAS_1 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real SEAS_2
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname SEAS_2
 input_wrf.F reading 4d real SEAS_2 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real SEAS_3
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname SEAS_3
 input_wrf.F reading 4d real SEAS_3 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real SEAS_4
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname SEAS_4
 input_wrf.F reading 4d real SEAS_4 Status =        -1021
input_wrf.F reading 4d real P10
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115          34         115
 ps            1           1           1
 pe          115          34         115
 ms           -4           1          -4
 me          121          35         121
  module_io.F: in wrf_read_field
   NetCDF error: NetCDF: Variable not found
   NetCDF error in wrf_io.F90, line        2861  Varname P10
 input_wrf.F reading 4d real P10 Status =        -1021
input_wrf.F reading 0d integer lakeflag
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de            1           1           1
 ps            1           1           1
 pe            1           1           1
 ms            1           1           1
 me            1           1           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 0d integer lakeflag Status =            0
input_wrf.F reading 0d integer lake_depth_flag
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de            1           1           1
 ps            1           1           1
 pe            1           1           1
 ms            1           1           1
 me            1           1           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 0d integer lake_depth_flag Status =            0
input_wrf.F reading 2d real landmask
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real landmask Status =            0
input_wrf.F reading 2d real lakemask
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real lakemask Status =            0
input_wrf.F reading 2d real sst
 date 2015-01-01_00:00:00
 ds            1           1           1
 de          115         115           1
 ps            1           1           1
 pe          115         115           1
 ms           -4          -4           1
 me          121         121           1
  module_io.F: in wrf_read_field
 input_wrf.F reading 2d real sst Status =            0
   input_wrf: end, fid =            2
  med_initialdata_input: back from input_input
  module_io.F: in wrf_ioclose
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    0.13296 elapsed seconds
   checking boundary conditions for grid
   boundary conditions OK for grid
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-05_00:00:00]
   DEBUG wrf_timeinttoa():  returning with str = [0000000000_006:000:000]
 DEBUG domain_setgmtetc():  get simStartTime from clock,  clock start time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG domain_setgmtetc():  get simStartTime from clock,  clock current time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG domain_setgmtetc():  get simStartTime from clock,  clock stop time = 2015-01-05_00:00:00
 DEBUG domain_setgmtetc():  get simStartTime from clock,  clock time step = 0000000000_006:000:000
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG domain_setgmtetc():  simulation start time = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG domain_setgmtetc():  julyr,hr,mn,sec,ms,julday =         2015           0           0           0           0           1
   DEBUG domain_setgmtetc():  gmt =    0.0000000
  start_domain_em: Before call to phy_init
  WRF TILE   1 IS      1 IE    116 JS      1 JE    116
  set_tiles3: NUMBER OF TILES =   1
  top of phy_init
   phy_init:  start_of_simulation =  T
  calling nl_get_iswater, nl_get_isice, nl_get_mminlu_loc
  after nl_get_iswater, nl_get_isice, nl_get_mminlu_loc
  module_start: phy_init: Before call to landuse_init
  top of landuse_init
INPUT LandUse = "USGS"
 LANDUSE TYPE = "USGS" FOUND          33  CATEGORIES           2  SEASONS WATER CATEGORY =           16  SNOW CATEGORY =           24
  returning from of landuse_init
  module_start: phy_init: Before call to ra_init
  module_start: phy_init: Before call to bl_init
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
 LANDUSE TYPE = USGS FOUND          27  CATEGORIES
 INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
 SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19  CATEGORIES
  module_start: phy_init: Before call to cu_init
  module_start: phy_init: Before call to shcu_init
  module_start: phy_init: Before call to mp_init
  module_start: phy_init: Before call to fg_init
  module_start: phy_init: Before call to fdob_init
  start_domain_em: After call to phy_init
  start_em: calling lightning_init
  start_em: after calling lightning_init
  calling inc/HALO_EM_INIT_1_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_2_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_3_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_4_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_5_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_INIT_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_MOIST_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_TKE_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_SCALAR_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_CHEM_inline.inc
*********************************************************************
*             PROGRAM:WRF/CHEM V3.6.1 MODEL
*                                                                   *
*    PLEASE REPORT ANY BUGS TO WRF/CHEM HELP at                     *
*                                                                   *
*              wrfchemhelp.gsd@noaa.gov                             *
*                                                                   *
*********************************************************************
  calling gocart and radmkpp driver from chem_driver
  calling biomass burning
  in chem_init
  call GOCARTRACM_KPP chem/aerosols initialization
  initializing dry dep (wesely)
  Setting last_chem_time to model start time-dt
  calling inc/HALO_EM_INIT_1_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_2_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_3_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_4_inline.inc
  calling inc/HALO_EM_INIT_5_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_INIT_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_MOIST_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_TKE_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_SCALAR_inline.inc
  calling inc/PERIOD_BDY_EM_CHEM_inline.inc
  start_domain_em: Returning
   wrfinput open error check
   past opening wrfinput_d01
  module_io.F: in wrf_ioclose
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-05_00:00:00]
   DEBUG wrf_timeinttoa():  returning with str = [0000000000_000:000:030]
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock start time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock current time = 2015-01-01_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock stop time = 2015-01-05_00:00:00
 DEBUG setup_timekeeping():  clock after creation,  clock time step = 0000000000_000:000:030
   setup_timekeeping:  set xtime to    0.0000000
   setup_timekeeping:  set julian to    0.0000000
  setup_timekeeping:  returning...
   DEBUG wrf_timetoa():  returning with str = [2015-01-01_00:00:00]
   current_time 2015-01-01_00:00:00
   READ GOCART BACKGROUND DATA
At line 389 of file convert_emiss.f90 (unit = 19, file = 'wrf_gocart_backg')
Fortran runtime error: End of file



this one is my namelist.input. Maybe i missed something in the chemistry options?

Code: Select all
&time_control           
run_days                 = 0,
run_hours                = 0,
run_minutes              = 0,
run_seconds              = 0,
start_year               = 2015,
start_month              = 01,
start_day                = 01,
start_hour               = 00,
start_minute             = 00,
start_second             = 00,
end_year                 = 2015,
end_month                = 01,
end_day                  = 05,
end_hour                 = 00,
end_minute               = 00,
end_second               = 00,
interval_seconds         = 21600,
input_from_file          = .true.,
history_interval         = 60,
frames_per_outfile       = 1,
restart                  = .false.,
restart_interval         = 5000,
io_form_history          = 2,
io_form_restart          = 2,
io_form_input            = 2,
io_form_boundary         = 2,
auxinput6_inname         = 'wrfbiochemi_d01',
auxinput7_inname         = 'wrffirechemi_d01',
auxinput8_inname         = 'wrfchemi_gocart_bg_d01',
auxinput12_inname        = 'wrf_chem_input',
auxinput13_inname        = 'wrfchemv_d01',
auxinput5_inname         = 'wrfchemi_d01'
auxinput5_interval_m     = 60,
auxinput7_interval_m     = 60,
auxinput8_interval_m     = 60,
auxinput13_interval_m    = 60,
io_form_auxinput2        = 2,
io_form_auxinput5        = 2,
io_form_auxinput6        = 2,
io_form_auxinput7        = 2,
io_form_auxinput8        = 2,
io_form_auxinput12       = 0,
io_form_auxinput13       = 0,
debug_level              = 1000,
/

&domains                 
time_step                = 30,
time_step_fract_num      = 0,
time_step_fract_den      = 1,
max_dom                  = 1,
e_we                     = 116,
e_sn                     = 116,
e_vert                   = 35,
p_top_requested          = 5000,
num_metgrid_levels       = 27,
num_metgrid_soil_levels  = 4,
dx                       = 5000,
dy                       = 5000,
grid_id                  = 1,
parent_id                = 1,
i_parent_start           = 1,
j_parent_start           = 1,
parent_grid_ratio        = 1,
parent_time_step_ratio   = 1,
feedback                 = 1,
smooth_option            = 0,
/

&physics                 
mp_physics               = 6,
ra_lw_physics            = 1,
ra_sw_physics            = 1,
radt                     = 10,
sf_sfclay_physics        = 1,
sf_surface_physics       = 2,
bl_pbl_physics           = 1,
bldt                     = 0,
cu_physics               = 5,
cu_diag                  = 1,
cudt                     = 5,
isfflx                   = 1,
ifsnow                   = 0,
icloud                   = 1,
surface_input_source     = 1,
num_soil_layers          = 4,
sf_urban_physics         = 0,
maxiens                  = 1,
maxens                   = 3,
maxens2                  = 3,
maxens3                  = 16,
ensdim                   = 144,
/

&fdda                   
/

&dynamics               
w_damping                = 0,
diff_opt                 = 1,
km_opt                   = 4,
diff_6th_opt             = 0,
diff_6th_factor          = 0.12,
base_temp                = 290.,
damp_opt                 = 0,
zdamp                    = 5000.,
dampcoef                 = 0.2,
khdif                    = 0,
kvdif                    = 0,
non_hydrostatic          = .true.,
moist_adv_opt            = 1,
scalar_adv_opt           = 1,
/

&bdy_control             
spec_bdy_width           = 5,
spec_zone                = 1,
relax_zone               = 4,
specified                = .true.,
nested                   = .false.,
/

&grib2                   
/

&namelist_quilt         
nio_tasks_per_group      = 0,
nio_groups               = 1,
/

&chem
 kemit                               = 1,
 chem_opt                            = 302,
 bioemdt                             = 0,
 photdt                              = 0,
 chemdt                              = 5,
 io_style_emissions                  = 2, 
 emiss_opt                           = 5,         
 emiss_opt_vol                       = 0,         
 emiss_ash_hgt                       = 0., 
 chem_in_opt                         = 0,         
 phot_opt                            = 0,         
 gas_drydep_opt                      = 1,           
 aer_drydep_opt                      = 1,         
 bio_emiss_opt                       = 0,         
 dust_opt                            = 3,
 dmsemis_opt                         = 1,
 seas_opt                            = 0,
 gas_bc_opt                          = 1,         
 gas_ic_opt                          = 1,         
 aer_bc_opt                          = 1,         
 aer_ic_opt                          = 1,         
 gaschem_onoff                       = 1,         
 aerchem_onoff                       = 1,         
 wetscav_onoff                       = 0,         
 cldchem_onoff                       = 0,         
 vertmix_onoff                       = 1,         
 chem_conv_tr                        = 1,         
 biomass_burn_opt                    = 0,         
 plumerisefire_frq                   = 0,         
 have_bcs_chem                       = .true.,
 aer_ra_feedback                     = 0,
 aer_op_opt                          = 1,
 opt_pars_out                        = 0,
 diagnostic_chem                     = 10000,
 /
                                                                                                                                                     


and lastly is the prep_chem_src.inp

Code: Select all
  $RP_INPUT
!#################################################################
!  CCATT-BRAMS/MCGA-CPTEC/WRF-Chem/FIM-Chem emission models CPTEC/INPE
!  version 1.3: May 2012                                             
!  contact: gmai@cptec.inpe.br   - http://meioambiente.cptec.inpe.br
!#################################################################

 
!---------------- grid_type of the grid output
   grid_type= 'mercator',
            !'rams' = rams grid
            ! 'polar'  = polar sterog. grid output
                        ! 'gg'  = gaussian grid output
         ! 'll'  = lat/lon grid output
         ! 'lambert'  = lambert grid output
         ! 'mercator' = mercator grid output
 
!---------------- if the output data is for use in CATT-BRAMS model, provide at least one analysis file
!---------------- of this model (only for grid_type= 'rams')
    rams_anal_prefix = '../ANL/OPQUE',
!---------------- date of emission 
    ihour=00,
    iday=01,
    imon=01,
    iyear=2015,

 !---------------- select the sources datasets to be used
   use_retro=1,  ! 1 = yes, 0 = not
   retro_data_dir= '/home/earth/Desktop/Jake/GlobalEmissions/PREP-CHEM-SRC-1.4/Global_emissions_v3/Emission_data/RETRO/anthro',

   use_edgar =2,  ! 0 - not, 1 - Version 3, 2 - Version 4 for some species
   edgar_data_dir='/home/earth/Desktop/Jake/GlobalEmissions/PREP-CHEM-SRC-1.4/Global_emissions_v3/Emission_data/EDGARV4',

   use_gocart=1,
   gocart_data_dir='/home/earth/Desktop/Jake/GlobalEmissions/PREP-CHEM-SRC-1.4/Global_emissions_v3/Emission_data/GOCART/emissions',

   use_streets =0,
   streets_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/STREETS',

   use_seac4rs =0,
   seac4rs_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/SEAC4RS',
   

   use_fwbawb =0,
   fwbawb_data_dir ='./model_datain/EMISSION_DATA/Emissions_Yevich_Logan',

   use_bioge =0, ! 1 - geia, 2 - megan
   ! ######
   ! # BIOGENIC = 1
   !bioge_data_dir ='/home/poluicao/EMISSION_DATA/biogenic_emissions',
   ! # MEGAN = 2
   ! ######   
   bioge_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/MEGAN/2000',   
   ! ######

   use_gfedv2=0,
   gfedv2_data_dir='./model_datain/EMISSION_DATA/GFEDv2-8days',
   
   use_bbem=0,
   use_bbem_plumerise=0,
 
!--------------------------------------------------------------------------------------------------

!---------------- if  the merging of gfedv2 with bbem is desired (=1, yes, 0 = no)
   merge_GFEDv2_bbem =0,
!---------------- Fire product for BBBEM/BBBEM-plumerise emission models
   bbem_wfabba_data_dir  ='NONE',
   bbem_modis_data_dir    ='NONE',
   bbem_inpe_data_dir     ='NONE',
   bbem_extra_data_dir    ='NONE',

!---------------- veg type data set (dir + prefix)
   veg_type_data_dir      ='/home/earth/Desktop/Jake/GlobalEmissions/PREP-CHEM-SRC-1.4/Global_emissions_v3/surface_data ',


!---------------- vcf type data set (dir + prefix)
  use_vcf = 0,
  vcf_type_data_dir      ='./model_datain/SURFACE_DATA/VCF/data_out/2005/VCF',
!---------------- olson data set (dir + prefix) 
  olson_data_dir      ='./model_datain/EMISSION_DATA/OLSON2/OLSON',       
 
       

!---------------- carbon density data set (dir + prefix)
   
   carbon_density_data_dir='./model_datain/SURFACE_DATA/GL_OGE_INPE/OGE',
   
   fuel_data_dir      ='./model_datain/EMISSION_DATA/Carbon_density_Saatchi/amazon_biomass_final.gra',
 

!---------------- gocart background
   use_gocart_bg=1,
   gocart_bg_data_dir='/home/earth/Desktop/Jake/GlobalEmissions/PREP-CHEM-SRC-1.4/Global_emissions_v3/Emission_data/GOCART',

!---------------- volcanoes emissions
   use_volcanoes =0,
   volcano_index =0, !REDOUBT

   use_these_values='NONE',
! define a text file for using external values for INJ_HEIGHT, DURATION,
! MASS ASH (units are meters - seconds - kilograms) and the format for
! a file 'values.txt' is like this:
! 11000. 10800. 1.5e10
! use_these_values='values.txt',
   begin_eruption='198912141930',  !begin time UTC of eruption YYYYMMDDhhmm   

!---------------- degassing volcanoes emissions
   use_degass_volcanoes =0,
   degass_volc_data_dir ='./model_datain/EMISSION_DATA/VOLC_SO2',

!---------------- user specific  emissions directory
!---------------- Update for South America megacities
!---------------- set 'NONE' if you do not want to use
   user_data_dir='NONE',


!--------------------------------------------------------------------------------------------------
   pond=1,   ! mad/mfa  0 -> molar mass weighted
             !          1 -> Reactivity weighted   

!---------------- for grid type 'll' or 'gg' only
   grid_resolucao_lon=1.,
   grid_resolucao_lat=1.,

   nlat=192,          ! if gg (only global grid)
   lon_beg   = -85., ! (-180.:+180.) long-begin of the output file
   lat_beg   = -55., ! ( -90.:+90. ) lat -begin of the output file
   delta_lon =  60., ! total long extension of the domain (360 for global)
   delta_lat =  70., ! total lat  extension of the domain (180 for global)

!---------------- For regional grids (polar or lambert)

   NGRIDS   = 1,            ! Number of grids to run

   NNXP     = 116,       ! Number of x gridpoints
   NNYP     = 116,        ! Number of y gridpoints
   NXTNEST  = 0          ! Grid number which is the next coarser grid
   DELTAX   = 5000.,
   DELTAY   = 5000.,         ! X and Y grid spacing

   ! Nest ratios between this grid and the next coarser grid.
   NSTRATX  = 1,2,3,4,           ! x-direction
   NSTRATY  = 1,2,3,4           ! y-direction

   NINEST = 0,        ! Grid point on the next coarser
   NJNEST = 0,        !  nest where the lower southwest
                             !  corner of this nest will start.
                             !  If NINEST or NJNEST = 0, use CENTLAT/LON
   POLELAT  = 14.58,          ! If polar, latitude/longitude of pole point
   POLELON  = 121.00,         ! If lambert, lat/lon of grid origin (x=y=0.)

   STDLAT1  = 14.58,          ! If polar for BRAMS, use 90.0 in STDLAT2
   STDLAT2  = 14.58,          ! If lambert, standard latitudes of projection
                     !(truelat2/truelat1 from namelist.wps, STDLAT1 < STDLAT2)
                            ! If mercator STDLAT1 = 1st true latitude
   CENTLAT  = 14.58,
   CENTLON  = 121.00,



!---------------- model output domain for each grid (only set up for rams)
   lati =  -90.,  -90.,   -90.,
   latf =  +90.,  +90.,   +90., 
   loni = -180., -180.,  -180.,
   lonf =  180.,  180.,   180.,

!---------------- project rams grid (polar sterogr) to lat/lon: 'YES' or 'NOT'
   proj_to_ll='YES',
   
!---------------- output file prefix (may include directory other than the current)
   chem_out_prefix = 'WRF-CHEM-TEST',
   chem_out_format = 'vfm',
!---------------- convert to WRF/CHEM (yes,not)
  special_output_to_wrf = 'YES',
   
$END 


Hoping someone could help me with all this as I am not fully familiar with the chemistry module

Thanks!
Jake
 
Posts: 2
Joined: Thu Jun 11, 2015 12:12 am

Re: Convert_emiss error

Postby Elirainy » Wed Apr 18, 2018 7:03 pm

Jake,
how did you solve this? I'm facing the same problem.

Best,
Ellie
Elirainy
 
Posts: 2
Joined: Mon Apr 16, 2018 3:02 pm


Return to Runtime Problems

Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 2 guests

cron