WPS 3.6 - Metgrig errors "WRF_DEBUG: NetCDF error:"

Having problems running the WRF Preprocessing Sysmte (WPS)?

WPS 3.6 - Metgrig errors "WRF_DEBUG: NetCDF error:"

Postby Gippox » Mon May 05, 2014 4:35 pm

I have compiled WPS 3.6 correctly (ifort + icc) but i see in the metgrid.log a plethora of errors such as:

WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line 83 Element FLAG_VAR_SSO

Code: Select all
Processing domain 1 of 2
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_XLAT_M                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                         WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                         ement FLAG_XLONG_M                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_XLAT_V                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_XLONG_V                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_XLAT_U                                                             
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                         
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                         
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_XLONG_U                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_CLAT                                                               
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_CLONG                                                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_d                               
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_d
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_M                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_V                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_U                                                           
                                       om_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                 om_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                                                         
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_MX                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_VX                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_UX                                                           
                                                                                           
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                       
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                           
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_MY                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_VY                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_MAPFAC_UY                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DE                                                     
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                         
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                    BUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_E                                                                   
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_F                                                                   
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_SINALPHA                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_COSALPHA                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_LANDMASK                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_LANDUSEF                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_n ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
    ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
   cd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_LU_INDEX                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_HGT_M                                                               
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_SOILTEMP                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line                                   
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                       
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: Warning Status =          -14 in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, li
 ne          57                                                                 
              83 El
 ement FLAG_SOILCTOP                                                           
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_SCT_DOM                                                             
                                                                               
                             
 WRF_DEBUG: NetCDF error: NetCDF: Attribute not found
 WRF_DEBUG: NetCDF error in ext_ncd_get_dom_ti.code INTEGER, line          83 El
 ement FLAG_SOILCBOT                                                           

With WPS 3.5.1 and 3.4.1 this does not happen.
WPS despite these errors, however, generates the initialization files met_em ***.nc

I've checked with ncview and these variables are still there.
Any suggestions?

Thanks
Gippox
 
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Re: WPS 3.6 - Metgrig errors "WRF_DEBUG: NetCDF error:"

Postby dcvz » Tue May 06, 2014 4:23 am

If you turn debugging off you won't see those messages. As you've found, the metgrid output is not affected.

The reason for the messages is rather silly, but they can't easily be prevented. Just ignore them.
dcvz
 
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Re: WPS 3.6 - Metgrig errors "WRF_DEBUG: NetCDF error:"

Postby Gippox » Wed May 07, 2014 1:12 pm

Ok thanks for reply.

Gippox
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Re: WPS 3.6 - Metgrig errors "WRF_DEBUG: NetCDF error:"

Postby hagridrubeus » Fri Dec 18, 2015 12:22 am

dcvz wrote:If you turn debugging off you won't see those messages. As you've found, the metgrid output is not affected.

The reason for the messages is rather silly, but they can't easily be prevented. Just ignore them.


Could you give some explanation about the "silly reason". I searched the codes, and think the complains was reported during processing static fields in metgrid. But I can not locate the codes which produce the error message.
Hope you are still active in the forum, because this is a old post.
hagridrubeus
 
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